Biowerin vedenpuhdistussovellukset toimivat biologisesti bakteereita hyödyntäen. Puhdistamoiden energian kulutus on vähäistä, eikä tilan tarvekaan ole suuri. Perinteisten, isoja altaita vaativien puhdistusprosessien koko on saatu niissä puristettua murto-osaan aiemmasta. Samalla puhdistuksen energian tarve on pystytty minimoimaan tehokkaalla prosessitekniikalla. Modulaarisen rakenteensa ansiosta puhdistusyksiköt soveltuvat niin pieniin kuin suuriinkin kohteisiin asuinrakennuksista teollisuuslaitoksiin ja kokonaisiin asutuskeskuksiin.

Puhdistamoissa käytetään erikoistuneita täsmäbakteereita ja tarvittaessa flotaatiotekniikkaa. Sovellusten puhdistuskirjo on siten varsin laaja, olivatpa sitten kyseessä kemialliset tai orgaaniset epäpuhtaudet veteen liuenneina tai sekoittuneina.